26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1011 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1011  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1283  hypothetical protein  66.67 
 
 
121 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1835  hypothetical protein  71.11 
 
 
99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000551501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2085  hypothetical protein  57.85 
 
 
124 aa  144  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.141987 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.89 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.04 
 
 
133 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.52 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.4 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  30.58 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.55 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.35 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  36.51 
 
 
129 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  32.94 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.67 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.79 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  34.95 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.51 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.07 
 
 
136 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.51 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.83 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.3 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.65 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.06 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  27.82 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>