66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0062 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 		 141 aa  275  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  45.83 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  37.96 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.02 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  39.2 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  32.62 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.61 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.2 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  31.51 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.69 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.81 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  39.09 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.06 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  30.08 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  33.93 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.56 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  39.81 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  44.16 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.11 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  33.93 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.93 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  32.43 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  29.66 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.47 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  33.93 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.35 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  32.8 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  36.79 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  30.36 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.48 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.41 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.63 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.37 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  28.57 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20141  hypothetical protein  26.55 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0620041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.37 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.17 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  37.08 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.59 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1283  hypothetical protein  40.79 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  32.35 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.07 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  30.93 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.83 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.89 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1011  hypothetical protein  37.89 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  28.26 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  29.03 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  29.79 
 
 		 236 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  32.11 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1835  hypothetical protein  30.21 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000551501 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1140  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  24.78 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.811277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  29.84 
 
 		 140 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  30.93 
 
 		 237 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  29.9 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  28.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  30.3 
 
 		 245 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  33.33 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.06 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>