84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1979 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  100 
 
 		 133 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  95.49 
 
 		 133 aa  258  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  66.67 
 
 		 132 aa  173  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  61.9 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  47.01 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  43.7 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  43.8 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  42.22 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  43.2 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  41.6 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  38.93 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  42.2 
 
 		 164 aa  94.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.82 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.5 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  34.92 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0989  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.77 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  35.07 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1696  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.25 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0603262  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  31.78 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  35.77 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.07 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1100  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.77 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.952576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1965  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.56 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  34.81 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.85 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  39.09 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.65 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.07 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.82 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.08 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3836  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.33 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.818865  normal  0.112998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3924  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.33 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3850  Mov34/MPN/PAD-1  34.33 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  32.86 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.58 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1009  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.09 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.86 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2119  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.62 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1673  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.73 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4293  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.07 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.23 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1539  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.15 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.54 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  34.59 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.45 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.55 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  30.83 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.63 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.69 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  32.14 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.03 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3576  hypothetical protein  31.87 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.284289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3610  hypothetical protein  31.36 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442363  normal  0.0106905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24.16 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  31.48 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3492  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1011  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3645  hypothetical protein  31.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  35.23 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 251 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  27.78 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  32.61 
 
 		 242 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4180  hypothetical protein  26.49 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.921596  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  29.37 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2021  hypothetical protein  31.62 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649005  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  29.81 
 
 		 264 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  26.13 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1283  hypothetical protein  32.91 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  36.11 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1835  hypothetical protein  31.34 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000551501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  27.05 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  25.89 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.09 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0171  hypothetical protein  28.4 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  28.87 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.24 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.03 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  24.79 
 
 		 155 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  30.68 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>