49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1941 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1941  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.653496  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0389  hypothetical protein  48.67 
 
 
150 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  44.37 
 
 
167 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  37.27 
 
 
164 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20141  hypothetical protein  27.98 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0620041  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1140  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  27.98 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.811277  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  34.78 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.29 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  35.71 
 
 
134 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.54 
 
 
136 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.77 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.77 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  32.04 
 
 
155 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0094  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  40.74 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.43 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.29 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  27.01 
 
 
165 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.45 
 
 
153 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.77 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  29.46 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.43 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.19 
 
 
139 aa  52  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.39 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.06 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1979  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.67 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.439505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  29.13 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  26.72 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  34.58 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  24 
 
 
130 aa  48.5  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.66 
 
 
132 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2241  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.67 
 
 
133 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  27.68 
 
 
143 aa  48.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.9 
 
 
141 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  32.2 
 
 
139 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  26.61 
 
 
143 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.29 
 
 
133 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.83 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  33.33 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  30.83 
 
 
129 aa  45.1  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.66 
 
 
138 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.29 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.11 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  31.91 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  23.39 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  28.7 
 
 
237 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.91 
 
 
130 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.95 
 
 
142 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1653  Mov34/MPN/PAD-1  29.92 
 
 
139 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.180806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>