46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0172 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0172  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  297  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  77.08 
 
 
143 aa  234  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  69.44 
 
 
143 aa  215  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0529  hypothetical protein  68.31 
 
 
143 aa  204  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  62.5 
 
 
144 aa  184  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  61.11 
 
 
143 aa  180  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.22 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.35 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.77 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2183  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.93 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.11 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.46 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.46 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.94 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  29.77 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.57 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22901  hypothetical protein  27.74 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.6 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0745  Mov34/MPN/PAD-1  29.29 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.749064  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.75 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.95 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0721  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.15 
 
 
157 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0427759  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  27.97 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0993  Mov34/MPN/PAD-1  28.57 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000289855  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1113  Mov34/MPN/PAD-1  31.91 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.640186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0062  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.93 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  28.08 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1289  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.82 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.87 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1850  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.4 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.62 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  30.58 
 
 
256 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1187  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.53 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1268  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.77 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.25 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0159  Mov34/MPN/PAD-1  27.19 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.843798  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.82 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  29.13 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  31.3 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16881  hypothetical protein  25.2 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.85 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  27.18 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  28.85 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  29.75 
 
 
256 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  34.41 
 
 
264 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0381  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.82 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0397123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>