73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  97.27 
 
 
256 aa  507  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  57.37 
 
 
251 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  53.39 
 
 
254 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  53.78 
 
 
264 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  56.49 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  42.91 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  41.63 
 
 
242 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  45.8 
 
 
250 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  44.06 
 
 
250 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  43.51 
 
 
250 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  43.31 
 
 
236 aa  198  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  38.67 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  42.21 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  41.8 
 
 
236 aa  181  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
240 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  40.32 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  32.38 
 
 
250 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  39.34 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  38.93 
 
 
247 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  38.78 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  39.18 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  37.14 
 
 
245 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  38.52 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  38.52 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  35.41 
 
 
252 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  36.73 
 
 
243 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  39.02 
 
 
247 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  39.02 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  37.3 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  39.81 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  39.81 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  39.81 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  39.81 
 
 
211 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  39.81 
 
 
211 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  35 
 
 
169 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  37.44 
 
 
203 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  38.58 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  38.58 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  32.37 
 
 
275 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  35.23 
 
 
272 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  34.47 
 
 
272 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  34.47 
 
 
272 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
275 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  34.47 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  33.45 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  37.37 
 
 
85 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.59 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1309  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.44 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.7 
 
 
130 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0866  Mov34/MPN/PAD-1  31.03 
 
 
134 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1689  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.58 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00143204  hitchhiker  0.00000496808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0533  hypothetical protein  30.38 
 
 
143 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.66224  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.36 
 
 
133 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.3 
 
 
137 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  32.74 
 
 
152 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0361  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  30.51 
 
 
134 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2370  Mov34/MPN/PAD-1  33.7 
 
 
135 aa  45.4  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.28 
 
 
132 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0488  hypothetical protein  33.66 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.35949  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0648  hypothetical protein  32.67 
 
 
143 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.635682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1569  Mov34/MPN/PAD-1  32.08 
 
 
132 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0127032  normal  0.479743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0646  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.46 
 
 
146 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3873  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.45 
 
 
137 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1725  Mov34/MPN/PAD-1  32.73 
 
 
138 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  0.175061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1236  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.44 
 
 
138 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0971  Mov34/MPN/PAD-1  36.78 
 
 
159 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1728  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  38.1 
 
 
129 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  35.48 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.86 
 
 
137 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0466  hypothetical protein  27.69 
 
 
143 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.5 
 
 
142 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>