50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3191 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  100 
 
 
211 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  100 
 
 
211 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  99.53 
 
 
211 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  100 
 
 
211 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  100 
 
 
211 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  96.19 
 
 
245 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  94.76 
 
 
247 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  93.36 
 
 
245 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  92.86 
 
 
247 aa  411  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  87.56 
 
 
247 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  86.6 
 
 
247 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  86.6 
 
 
247 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  86.6 
 
 
247 aa  391  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  84.21 
 
 
247 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  85.79 
 
 
199 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  85.79 
 
 
199 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  73.08 
 
 
243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  73.08 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  74 
 
 
203 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  40.1 
 
 
250 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  40.21 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  39.89 
 
 
237 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  38.94 
 
 
250 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  39.49 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  39.81 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  39.81 
 
 
256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  35.57 
 
 
250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  46.22 
 
 
169 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  35.64 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  36.19 
 
 
249 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  36.92 
 
 
236 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  33.49 
 
 
251 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  36.41 
 
 
236 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  35.85 
 
 
264 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  36.22 
 
 
236 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  35.78 
 
 
275 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  32.57 
 
 
254 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  36.87 
 
 
272 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  36.41 
 
 
272 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  36.87 
 
 
272 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  36.41 
 
 
272 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  35.94 
 
 
272 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  36.87 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  26.92 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  41.77 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.23 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  31.25 
 
 
476 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.15 
 
 
146 aa  41.6  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>