53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00748 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_10052  tail component  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  97.99 
 
 
247 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  97.99 
 
 
247 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  97.99 
 
 
247 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  91.96 
 
 
247 aa  391  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  92.46 
 
 
247 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  86.29 
 
 
247 aa  373  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  85.79 
 
 
211 aa  367  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  85.79 
 
 
211 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  85.79 
 
 
211 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  85.79 
 
 
211 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  85.79 
 
 
245 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  85.79 
 
 
211 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  84.77 
 
 
247 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  84.77 
 
 
245 aa  363  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  76.65 
 
 
203 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  76.14 
 
 
243 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  76.14 
 
 
245 aa  317  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  40.5 
 
 
250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  40.1 
 
 
250 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  40.22 
 
 
236 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  39.29 
 
 
250 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  39.57 
 
 
240 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  37.57 
 
 
242 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  38.17 
 
 
237 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  33.88 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  38.58 
 
 
256 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  38.58 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  43.7 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  36.87 
 
 
246 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  33.99 
 
 
249 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  36.22 
 
 
236 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  35.68 
 
 
236 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  36.14 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  40 
 
 
275 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.84 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  34.22 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  32.84 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  40.24 
 
 
272 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  40.24 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  39.63 
 
 
272 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  45.67 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  39.63 
 
 
272 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  32.49 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.07 
 
 
263 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  39.24 
 
 
85 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  33.09 
 
 
146 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  32.5 
 
 
366 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  28.75 
 
 
240 aa  45.1  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.94 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  35.37 
 
 
398 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>