44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3497 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  100 
 
 
263 aa  550  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  32.33 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  27.57 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  31.73 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  30.65 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  30.5 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  30 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  30 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  26.79 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  27.23 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  26.34 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  26.89 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  29.5 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  27.39 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  28.94 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  27.23 
 
 
211 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  27.23 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  27.23 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  27.23 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  27.23 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  26.73 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  26.43 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  26.73 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  26.73 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  26.47 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  28.63 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  25.37 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  29.17 
 
 
169 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  29.17 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  27.07 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  27.07 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  27.46 
 
 
203 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  24.77 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  29.06 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  30 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  27.59 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  29.17 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  28.22 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  29.47 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  27.09 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  26.83 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  29.03 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  29.3 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  27.06 
 
 
254 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>