51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1084 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  100 
 
 		 203 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  99.51 
 
 		 245 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  99.5 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  75.5 
 
 		 247 aa  327  7e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  75 
 
 		 247 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  76.5 
 
 		 247 aa  325  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  76.5 
 
 		 247 aa  325  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  76.5 
 
 		 247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  75.5 
 
 		 247 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  75.5 
 
 		 247 aa  323  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  75 
 
 		 245 aa  323  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  74.5 
 
 		 245 aa  321  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  74 
 
 		 211 aa  320  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  76.65 
 
 		 199 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  76.65 
 
 		 199 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  74 
 
 		 211 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  74 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  74 
 
 		 211 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  74 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  42.02 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  38.89 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  39.9 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 240 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  39.47 
 
 		 237 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  35.68 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  38.62 
 
 		 242 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  37.44 
 
 		 256 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  37.44 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  42.5 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  39.02 
 
 		 264 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  34.98 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  36.02 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  34.15 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  36.27 
 
 		 254 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  34.95 
 
 		 236 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  36.87 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 275 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  34.03 
 
 		 236 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  40.36 
 
 		 272 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 272 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  44.88 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  38.55 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  30 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  40.51 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.46 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  27.5 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  30 
 
 		 333 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.15 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>