56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1556 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  100 
 
 		 245 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  96.31 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  93.36 
 
 		 247 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  92.53 
 
 		 247 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  88.33 
 
 		 247 aa  453  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  86.67 
 
 		 247 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  86.67 
 
 		 247 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  87.08 
 
 		 247 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  87.08 
 
 		 247 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  93.84 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  93.36 
 
 		 211 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  93.36 
 
 		 211 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  93.33 
 
 		 211 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  93.33 
 
 		 211 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  73.66 
 
 		 243 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  73.66 
 
 		 245 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  85.79 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  85.79 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  75 
 
 		 203 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  42.11 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  39.5 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  38.22 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  38.78 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  38.37 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  37.5 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  40.09 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  34.38 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  36.89 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  34.96 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.11 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  36.21 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  34.75 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  35.84 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  45.38 
 
 		 169 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  32.52 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  35.1 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 272 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  30.43 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  34.84 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  26.34 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  41.77 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.3 
 
 		 138 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1140  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30 
 
 		 136 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.65 
 
 		 164 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.95 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  32.35 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.77 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  28.75 
 
 		 278 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.96 
 
 		 145 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>