55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1692 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  93.2 
 
 
250 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  76.11 
 
 
250 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  53.04 
 
 
246 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  51.84 
 
 
236 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  43.51 
 
 
256 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  42.75 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  41.7 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  42.17 
 
 
242 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  42.37 
 
 
264 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  41.06 
 
 
236 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  39.69 
 
 
251 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  38.78 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  39.31 
 
 
254 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  37.96 
 
 
236 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  40.66 
 
 
243 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  40.91 
 
 
245 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  42.68 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  39.92 
 
 
247 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  40.74 
 
 
247 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  38.68 
 
 
247 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  40.74 
 
 
247 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  40.74 
 
 
247 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  40.34 
 
 
245 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  39.09 
 
 
247 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  39.5 
 
 
245 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  37.86 
 
 
247 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  32.37 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  32.81 
 
 
249 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  34.03 
 
 
252 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  39.42 
 
 
211 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  38.89 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  38.94 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  38.94 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  38.16 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  38.16 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  39.29 
 
 
199 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  39.29 
 
 
199 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  33.71 
 
 
169 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  35.83 
 
 
275 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  35.27 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
272 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  34.85 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  34.44 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  35.54 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  34.02 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  41.86 
 
 
85 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  28.94 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.25 
 
 
130 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2540  Mov34/MPN/PAD-1  31.19 
 
 
139 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000146733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  32.89 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.33 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.13 
 
 
155 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  27.13 
 
 
155 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0951  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  37.11 
 
 
158 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>