52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1421 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  100 
 
 		 243 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  99.18 
 
 		 245 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  99.5 
 
 		 203 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  75.21 
 
 		 247 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  76.05 
 
 		 247 aa  384  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  73.66 
 
 		 245 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  75.63 
 
 		 247 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  73.95 
 
 		 247 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  75.21 
 
 		 247 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  75.63 
 
 		 247 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  73.25 
 
 		 245 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  73.95 
 
 		 247 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  73.08 
 
 		 211 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  73.08 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  73.08 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  73.08 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  73.08 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  76.14 
 
 		 199 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  76.14 
 
 		 199 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  41.49 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  40.66 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  42.15 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  38.5 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  37.33 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  33.78 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  36.73 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  37.78 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  37.5 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  33.88 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  36.48 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  36.73 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  34.98 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  34.55 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  41.67 
 
 		 169 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  34.15 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  34.69 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  34.66 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  33.88 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  33.47 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  29.55 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  40.51 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  26.47 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3493  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.96 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.21 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  30 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.82 
 
 		 164 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>