52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0092 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  100 
 
 
252 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  37.4 
 
 
236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  36.65 
 
 
256 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  35.25 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  35.41 
 
 
256 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
250 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  34.03 
 
 
250 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  32.31 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  34.98 
 
 
237 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  37.18 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  33.2 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  33.2 
 
 
236 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  30.74 
 
 
246 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  31.28 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  27.66 
 
 
250 aa  115  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  30.29 
 
 
236 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  29.17 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  29.05 
 
 
236 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  34.63 
 
 
247 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  34.35 
 
 
247 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  27.89 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  32.61 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  29.78 
 
 
169 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  33.91 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  33.91 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  30.43 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  30.71 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  29.55 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  30.43 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  31.17 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  28.76 
 
 
247 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  32.49 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  32.49 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  29.33 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  26.92 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  26.92 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  26.92 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  26.92 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  27.71 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  30 
 
 
203 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  29.47 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  31.17 
 
 
142 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  28.33 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  29.37 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  28.74 
 
 
272 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  27.95 
 
 
272 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  28.4 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  28.8 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1227  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.41 
 
 
130 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  36.84 
 
 
151 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3645  hypothetical protein  31.13 
 
 
151 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  39.66 
 
 
85 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>