More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0335 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
199 aa  377  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.52 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.199605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.32 
 
 
199 aa  205  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.6 
 
 
206 aa  171  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.76 
 
 
205 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.78 
 
 
205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
205 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.78 
 
 
205 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.56 
 
 
205 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.52 
 
 
205 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.85 
 
 
205 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.59 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
205 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.32 
 
 
205 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  48.94 
 
 
212 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.12 
 
 
205 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.83 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0965  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.45 
 
 
223 aa  151  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
205 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2372  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.49 
 
 
229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.15 
 
 
205 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.39 
 
 
208 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.87 
 
 
208 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.87 
 
 
208 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.78 
 
 
224 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.55 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.78 
 
 
205 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.86 
 
 
209 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
201 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
201 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1104  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.55 
 
 
224 aa  140  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.451698  normal  0.544618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.56 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
205 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.57 
 
 
202 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.38 
 
 
224 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.33 
 
 
217 aa  136  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.14 
 
 
201 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.38 
 
 
224 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
223 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.127346  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.37 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.85 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.78 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.2 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3178  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.54 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.71 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.29 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  41 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  41 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
202 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.78 
 
 
208 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.95 
 
 
197 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
204 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.7 
 
 
200 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.29 
 
 
194 aa  121  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  40.32 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
209 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  34.87 
 
 
194 aa  119  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0785  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.48 
 
 
204 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247616  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  38 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.73 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  44.06 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 
197 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.06 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.32 
 
 
205 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
197 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
199 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.62 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
197 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.62 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
205 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
205 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.9 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
200 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
205 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.61 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.78 
 
 
197 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.5 
 
 
198 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.27 
 
 
200 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
199 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.61 
 
 
197 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
203 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.89 
 
 
200 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>