More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2905 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
204 aa  394  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.17 
 
 
205 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.4 
 
 
205 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  49.76 
 
 
212 aa  181  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.11 
 
 
208 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.11 
 
 
208 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.15 
 
 
208 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.92 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.4 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.33 
 
 
205 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.42 
 
 
205 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.52 
 
 
205 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.05 
 
 
205 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.85 
 
 
205 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.83 
 
 
206 aa  174  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.51 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.36 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.43 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.51 
 
 
204 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.02 
 
 
204 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.41 
 
 
205 aa  165  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
205 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.09 
 
 
205 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.83 
 
 
205 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.83 
 
 
205 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.2 
 
 
217 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.71 
 
 
209 aa  157  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.59 
 
 
199 aa  154  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.88 
 
 
205 aa  154  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
204 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.199605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.72 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3178  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.08 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0320  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.15 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.219542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.57 
 
 
205 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.57 
 
 
205 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.57 
 
 
205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.57 
 
 
205 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1104  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.44 
 
 
224 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.451698  normal  0.544618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.31 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.127346  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.49 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2372  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.85 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
197 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.69 
 
 
208 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
202 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0965  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.36 
 
 
223 aa  127  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
206 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.2 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.64 
 
 
224 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.64 
 
 
224 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.19 
 
 
201 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.19 
 
 
201 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.84 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0683  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
190 aa  125  5e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
198 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.51 
 
 
197 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.07 
 
 
199 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.6 
 
 
197 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.6 
 
 
197 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0785  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.26 
 
 
204 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247616  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.86 
 
 
193 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.45 
 
 
204 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.6 
 
 
197 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
193 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
193 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
201 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.1 
 
 
200 aa  121  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.84 
 
 
202 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
203 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.78 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.27 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
193 aa  118  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  40.54 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37.62 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
207 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.2 
 
 
192 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
202 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
201 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
200 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.38 
 
 
207 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
204 aa  114  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.73 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.27 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.27 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.15 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>