More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0320 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0320  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
190 aa  381  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.219542  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0683  Holliday junction DNA helicase RuvA  91.05 
 
 
190 aa  330  8e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1113  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.46 
 
 
190 aa  178  4e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  31.75 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.71 
 
 
205 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.29 
 
 
208 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.26 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.26 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.57 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0574  holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
193 aa  110  9e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  30.73 
 
 
205 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.67 
 
 
205 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.09 
 
 
205 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
205 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
205 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.04 
 
 
200 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
205 aa  104  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.92 
 
 
205 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
199 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
205 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.85 
 
 
209 aa  101  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.27 
 
 
203 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
195 aa  99  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
199 aa  98.2  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.13 
 
 
205 aa  97.8  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.79 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.11 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.41 
 
 
193 aa  94.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
220 aa  94  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0785  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.37 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247616  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.15 
 
 
199 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.61 
 
 
205 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1613  DNA recombination protein RuvA domain I  34.04 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.29 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.68 
 
 
187 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.62 
 
 
204 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
200 aa  91.3  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.94 
 
 
184 aa  90.9  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.41 
 
 
202 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.37 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  29.13 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.9 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2372  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.61 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.81 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
197 aa  89  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.09 
 
 
223 aa  88.6  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.127346  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.06 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.06 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.9 
 
 
205 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  30.93 
 
 
193 aa  87.8  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.39 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.39 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.39 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.25 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.18 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.26 
 
 
197 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0965  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.43 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  29.21 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  29.21 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  29 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1104  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
224 aa  85.5  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.451698  normal  0.544618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.79 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>