More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0574 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0574  holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1113  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
190 aa  115  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0320  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
190 aa  110  9e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.219542  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0683  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.02 
 
 
190 aa  105  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
206 aa  104  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
205 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.09 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
217 aa  94.4  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
208 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.14 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.47 
 
 
205 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
208 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.72 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.53 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
205 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.68 
 
 
209 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.72 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 
202 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
205 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.69 
 
 
193 aa  92  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.09 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.12 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  33.52 
 
 
212 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.85 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  33.17 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.83 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.83 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.02 
 
 
204 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.7 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.01 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.01 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.96 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
198 aa  85.1  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.01 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
205 aa  84.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.5 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.94 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.47 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.95 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.61 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.26 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.8 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.59 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.59 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.59 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.7 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.79 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.79 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  30.41 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.05 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.16 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  28.71 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  31.96 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.29 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.23 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  28.71 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.33 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.14 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.72 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.75 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.89 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0457  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.56 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3953  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.61 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0761943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  29.9 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.86 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.09 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>