More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2720 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.34 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.93 
 
 		 192 aa  238  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.2 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.97 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.9 
 
 		 193 aa  230  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.42 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.03 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.51 
 
 		 193 aa  224  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0392  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.56 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.05 
 
 		 193 aa  222  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3953  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.45 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0761943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0377  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.05 
 
 		 193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.41 
 
 		 192 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.45 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.33 
 
 		 190 aa  218  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.42 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  57.58 
 
 		 191 aa  217  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 		 193 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4068  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.41 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.41 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3700  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.36 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0493  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.91 
 
 		 190 aa  208  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0568272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4094  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.9 
 
 		 190 aa  204  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.49 
 
 		 193 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.49 
 
 		 193 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.51 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.51 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.51 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.51 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.27 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0510  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.84 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.5 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0739  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.88 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0805847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.01 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.01 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.5 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.53 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.99 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  48 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  48 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  48 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.5 
 
 		 205 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.26 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.24 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.22 
 
 		 199 aa  184  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.55 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.21 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.21 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.85 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  45.27 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.28 
 
 		 223 aa  175  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.34 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.84 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  48.28 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.83 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.39 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.44 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.39 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.06 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.06 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.52 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.52 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.67 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.14 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.99 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.46 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.1 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.5 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.71 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 		 205 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 		 205 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 		 205 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 		 205 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.7 
 
 		 203 aa  167  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.04 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.97 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.41 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.92 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>