More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0952 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
197 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  97.46 
 
 
197 aa  340  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  97.46 
 
 
197 aa  338  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  76.65 
 
 
197 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.5 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.47 
 
 
198 aa  161  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.22 
 
 
199 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.27 
 
 
199 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.94 
 
 
199 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.65 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.43 
 
 
199 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.56 
 
 
199 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.18 
 
 
197 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.71 
 
 
205 aa  144  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.33 
 
 
203 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.69 
 
 
202 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.93 
 
 
205 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.93 
 
 
205 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.44 
 
 
205 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.79 
 
 
204 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.93 
 
 
205 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.78 
 
 
205 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.31 
 
 
205 aa  141  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.25 
 
 
205 aa  141  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.04 
 
 
205 aa  140  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.04 
 
 
205 aa  140  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  43 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.65 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.65 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.22 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
202 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.67 
 
 
193 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.67 
 
 
193 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  43 
 
 
206 aa  138  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.31 
 
 
204 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.58 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.57 
 
 
205 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.31 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.29 
 
 
202 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.29 
 
 
202 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.31 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.31 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.31 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.52 
 
 
209 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.31 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.15 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3909  Holliday junction DNA helicase RuvA  43 
 
 
210 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.776913  normal  0.119869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  40.78 
 
 
203 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.5 
 
 
199 aa  134  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.79 
 
 
205 aa  134  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.48 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.57 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.15 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.16 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.91 
 
 
205 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.68 
 
 
206 aa  131  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  42.05 
 
 
191 aa  131  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.59 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.65 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.41 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.15 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.4 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.61 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.39 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4068  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.52 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.851819 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
203 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  43.01 
 
 
212 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 
203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.56 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.68 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.14 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.89 
 
 
192 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
205 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.96 
 
 
214 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  39.61 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.36 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  39.61 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.36 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.71 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.59 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.62 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
203 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
200 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.9 
 
 
193 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.19 
 
 
206 aa  124  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>