More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2353 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.25 
 
 
193 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.77 
 
 
193 aa  255  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.77 
 
 
193 aa  254  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.55 
 
 
200 aa  253  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.36 
 
 
190 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.18 
 
 
190 aa  248  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.95 
 
 
192 aa  247  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0377  Holliday junction DNA helicase RuvA  68.04 
 
 
193 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.53 
 
 
193 aa  246  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.84 
 
 
193 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0392  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.84 
 
 
193 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.28 
 
 
193 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3953  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.36 
 
 
191 aa  244  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0761943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  62.69 
 
 
191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.8 
 
 
193 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.8 
 
 
193 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.8 
 
 
193 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.8 
 
 
193 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.8 
 
 
193 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.8 
 
 
193 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.8 
 
 
193 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.25 
 
 
193 aa  238  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.25 
 
 
193 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.07 
 
 
193 aa  236  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.18 
 
 
190 aa  235  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.2 
 
 
197 aa  235  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3700  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.36 
 
 
190 aa  235  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.73 
 
 
192 aa  235  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0493  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.36 
 
 
190 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0568272  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.76 
 
 
193 aa  231  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.21 
 
 
193 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.73 
 
 
193 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.73 
 
 
193 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.73 
 
 
193 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.21 
 
 
193 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.73 
 
 
193 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0510  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.18 
 
 
192 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4094  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.21 
 
 
190 aa  225  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0739  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.21 
 
 
190 aa  222  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0805847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4068  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.4 
 
 
191 aa  218  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.25 
 
 
202 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.25 
 
 
202 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.74 
 
 
205 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.74 
 
 
205 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.74 
 
 
205 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.56 
 
 
202 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.46 
 
 
203 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.46 
 
 
203 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.35 
 
 
202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.46 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.46 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.46 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.46 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.46 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  49.46 
 
 
203 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  49.46 
 
 
203 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  45.54 
 
 
203 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.37 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.37 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.37 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.37 
 
 
203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.37 
 
 
203 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.03 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.84 
 
 
223 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.31 
 
 
204 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2103  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.61 
 
 
205 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.81 
 
 
206 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.66 
 
 
207 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.57 
 
 
205 aa  175  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1819  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.85 
 
 
205 aa  175  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.91 
 
 
203 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.69 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2146  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.85 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.85 
 
 
205 aa  171  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.33 
 
 
203 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.38 
 
 
203 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.17 
 
 
205 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.18 
 
 
200 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.03 
 
 
206 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.57 
 
 
205 aa  168  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.79 
 
 
199 aa  168  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.77 
 
 
201 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.67 
 
 
200 aa  167  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.72 
 
 
200 aa  166  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.37 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  47.22 
 
 
206 aa  165  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.24 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.24 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.24 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.24 
 
 
205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.98 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.13 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.13 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>