More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2064 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
206 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  66.99 
 
 
206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  65.92 
 
 
196 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.75 
 
 
202 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  57.77 
 
 
200 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  58.74 
 
 
202 aa  208  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.56 
 
 
208 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.31 
 
 
200 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.73 
 
 
202 aa  198  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  54.19 
 
 
206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.19 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.62 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
200 aa  187  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.34 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.24 
 
 
206 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.28 
 
 
247 aa  178  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.75 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.78 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.37 
 
 
209 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.51 
 
 
213 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.51 
 
 
198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.28 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.28 
 
 
196 aa  161  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.05 
 
 
207 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.85 
 
 
214 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.07 
 
 
196 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  55.15 
 
 
239 aa  157  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.07 
 
 
196 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.07 
 
 
196 aa  157  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.27 
 
 
197 aa  157  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.88 
 
 
200 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  44.93 
 
 
209 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.92 
 
 
195 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  40.19 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  44.98 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.13 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.37 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.71 
 
 
197 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.06 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
201 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.89 
 
 
194 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.34 
 
 
206 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.51 
 
 
199 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.36 
 
 
194 aa  122  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
202 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.74 
 
 
202 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.45 
 
 
197 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.11 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.7 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  40.22 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
209 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
203 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.67 
 
 
187 aa  117  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.24 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.04 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.24 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.04 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.76 
 
 
205 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.04 
 
 
205 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.81 
 
 
205 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.93 
 
 
199 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.42 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.69 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  33.17 
 
 
194 aa  115  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.52 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.76 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.94 
 
 
208 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.94 
 
 
208 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.47 
 
 
201 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  34.04 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
208 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.9 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.9 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.18 
 
 
205 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
200 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
198 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  36 
 
 
206 aa  111  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.1 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.16 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.3 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.1 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.77 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
203 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
203 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
203 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
203 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
203 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.55 
 
 
198 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.21 
 
 
199 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.3 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>