More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_12890 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
214 aa  417  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.87 
 
 
213 aa  197  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.47 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.3 
 
 
207 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  48.33 
 
 
205 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.04 
 
 
202 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  48.31 
 
 
200 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.24 
 
 
206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.44 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50 
 
 
202 aa  160  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  48.06 
 
 
206 aa  158  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.55 
 
 
247 aa  158  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.89 
 
 
199 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.71 
 
 
200 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.67 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  43.66 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.5 
 
 
197 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.81 
 
 
196 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.04 
 
 
200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.95 
 
 
212 aa  144  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
209 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 
198 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.11 
 
 
200 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  47.8 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.02 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.02 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.02 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.2 
 
 
200 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.48 
 
 
208 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  52.63 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.02 
 
 
199 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
204 aa  125  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.04 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  36.81 
 
 
208 aa  121  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.92 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.43 
 
 
195 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.06 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.53 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.36 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.89 
 
 
202 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.96 
 
 
204 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1268  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.47 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.20539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.16 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.44 
 
 
202 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.62 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.44 
 
 
205 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.95 
 
 
201 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.19 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.57 
 
 
194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.47 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.36 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.36 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.07 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.07 
 
 
194 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.92 
 
 
202 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
201 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.94 
 
 
195 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  31.86 
 
 
194 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.71 
 
 
198 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
201 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.86 
 
 
206 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  36.11 
 
 
194 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
199 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
203 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.6 
 
 
200 aa  104  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.6 
 
 
200 aa  104  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.4 
 
 
199 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  34.95 
 
 
197 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.55 
 
 
201 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  34.27 
 
 
199 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
195 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3204  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
202 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
194 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
199 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  101  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.08 
 
 
190 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.92 
 
 
197 aa  101  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>