More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1795 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
202 aa  380  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  64.88 
 
 
206 aa  243  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  68.29 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.22 
 
 
207 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.56 
 
 
205 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  73.05 
 
 
209 aa  208  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  60.68 
 
 
200 aa  207  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  58.05 
 
 
202 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.59 
 
 
202 aa  194  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.74 
 
 
200 aa  188  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.73 
 
 
206 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.81 
 
 
199 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.72 
 
 
196 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.74 
 
 
200 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.65 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.65 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.35 
 
 
198 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.52 
 
 
200 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.76 
 
 
212 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.55 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55.14 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.75 
 
 
196 aa  171  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.04 
 
 
214 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.33 
 
 
208 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.24 
 
 
214 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.75 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.75 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.75 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.24 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  49.04 
 
 
205 aa  160  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.72 
 
 
197 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.02 
 
 
213 aa  158  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  57.22 
 
 
239 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.77 
 
 
195 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.72 
 
 
195 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.56 
 
 
199 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  37.98 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.28 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.36 
 
 
197 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
209 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  42.44 
 
 
194 aa  122  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.43 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.39 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.94 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
197 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.32 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.39 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.22 
 
 
201 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.25 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.45 
 
 
209 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
199 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.13 
 
 
195 aa  108  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.7 
 
 
202 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.61 
 
 
202 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.29 
 
 
202 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.16 
 
 
202 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  38.04 
 
 
194 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
205 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.92 
 
 
192 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.17 
 
 
201 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.17 
 
 
201 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.79 
 
 
197 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
199 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
199 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.52 
 
 
202 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
194 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
210 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  45.31 
 
 
197 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.47 
 
 
203 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.89 
 
 
199 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.47 
 
 
203 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
203 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.47 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
200 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.69 
 
 
204 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.87 
 
 
200 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
197 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.26 
 
 
200 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
198 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  34.47 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1268  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
204 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.20539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.44 
 
 
203 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.79 
 
 
197 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  35.12 
 
 
206 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  30.5 
 
 
199 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.31 
 
 
207 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>