More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2574 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
195 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  94.36 
 
 
195 aa  361  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  79.08 
 
 
196 aa  307  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  79.08 
 
 
196 aa  307  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  79.08 
 
 
196 aa  307  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  71.65 
 
 
196 aa  278  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  54.77 
 
 
199 aa  201  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.78 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.31 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.98 
 
 
199 aa  164  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.32 
 
 
207 aa  160  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50 
 
 
206 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.28 
 
 
205 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  46.53 
 
 
200 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.72 
 
 
202 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.12 
 
 
196 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.71 
 
 
206 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.79 
 
 
214 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.54 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  41 
 
 
213 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.88 
 
 
209 aa  134  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.5 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.62 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
197 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.58 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.6 
 
 
212 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  43.79 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.36 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.9 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.41 
 
 
202 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.78 
 
 
247 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.09 
 
 
205 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.92 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
204 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.56 
 
 
197 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
195 aa  118  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.35 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  34 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.52 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.27 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.76 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.14 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.95 
 
 
202 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.59 
 
 
204 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  35.75 
 
 
208 aa  111  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
197 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  38.25 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.25 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.83 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.31 
 
 
204 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.42 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.64 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.72 
 
 
198 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0726  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.39 
 
 
198 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.68 
 
 
193 aa  107  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
220 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
200 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.87 
 
 
190 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
200 aa  104  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1706  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
193 aa  104  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.07 
 
 
201 aa  104  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4464  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.9 
 
 
196 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.77 
 
 
211 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
188 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
200 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.66 
 
 
194 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.66 
 
 
197 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  36.36 
 
 
194 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
203 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
199 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.16 
 
 
200 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
200 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  31.82 
 
 
199 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.52 
 
 
201 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
198 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.37 
 
 
209 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  42.42 
 
 
206 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.29 
 
 
197 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0783  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
188 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
196 aa  101  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.92 
 
 
201 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
205 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
205 aa  101  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
193 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  30.05 
 
 
193 aa  101  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
193 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
200 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
200 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
195 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
202 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
205 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 
199 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 
199 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>