More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2032 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
213 aa  424  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  85.51 
 
 
214 aa  349  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.87 
 
 
214 aa  205  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.21 
 
 
202 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.23 
 
 
207 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  52.48 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.89 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.04 
 
 
205 aa  178  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.01 
 
 
202 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  47 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.08 
 
 
206 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  46.53 
 
 
199 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.09 
 
 
202 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  47.2 
 
 
205 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.54 
 
 
200 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  46.46 
 
 
196 aa  157  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.5 
 
 
197 aa  157  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.41 
 
 
209 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  45 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  45 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  45 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.03 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.05 
 
 
200 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.75 
 
 
212 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.12 
 
 
208 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  44.12 
 
 
206 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.51 
 
 
207 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.41 
 
 
247 aa  142  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
200 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.5 
 
 
196 aa  141  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.79 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.57 
 
 
200 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
199 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  35.78 
 
 
208 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  46.02 
 
 
239 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  40.3 
 
 
197 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
199 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
198 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  38 
 
 
195 aa  118  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.28 
 
 
204 aa  117  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.37 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.1 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1268  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.74 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.20539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.1 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.1 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37.13 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.31 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.52 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  109  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.94 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.95 
 
 
205 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
199 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 
195 aa  108  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  38.51 
 
 
194 aa  108  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.49 
 
 
192 aa  108  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
194 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.45 
 
 
205 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.19 
 
 
197 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
201 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
199 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
202 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.53 
 
 
208 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 
200 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.44 
 
 
202 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
194 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.08 
 
 
202 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  34.64 
 
 
199 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  36.07 
 
 
194 aa  105  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
200 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.97 
 
 
207 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
200 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
201 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
201 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1706  Holliday junction DNA helicase RuvA  34 
 
 
193 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
193 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
208 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
208 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.22 
 
 
204 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
192 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
193 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1323  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.25 
 
 
196 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0418911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.16 
 
 
199 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
193 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.37 
 
 
205 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
199 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.7 
 
 
201 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  34.86 
 
 
199 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
199 aa  101  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0639  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.27 
 
 
200 aa  101  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>