More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0577 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.15 
 
 
192 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.25 
 
 
196 aa  192  3e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
205 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
541 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.27 
 
 
205 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.03 
 
 
205 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.23 
 
 
199 aa  178  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.56 
 
 
201 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0926  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
194 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.06 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.61 
 
 
196 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.13 
 
 
196 aa  155  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
200 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.37 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.37 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
200 aa  124  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
201 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
204 aa  115  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.84 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.79 
 
 
197 aa  111  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.88 
 
 
208 aa  111  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  36.61 
 
 
194 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
189 aa  109  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.55 
 
 
205 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 
194 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.69 
 
 
210 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.69 
 
 
210 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 
194 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
223 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
201 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
201 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.1 
 
 
200 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.08 
 
 
207 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
203 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.16 
 
 
203 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  34.16 
 
 
203 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
192 aa  104  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  33.7 
 
 
203 aa  104  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.1 
 
 
200 aa  104  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.31 
 
 
193 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  104  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.21 
 
 
201 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
203 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
193 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
205 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
203 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.71 
 
 
196 aa  103  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
203 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.41 
 
 
203 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
199 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.12 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
197 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.5 
 
 
199 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.47 
 
 
194 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
204 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 
189 aa  102  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
204 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
205 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.26 
 
 
208 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.33 
 
 
193 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.39 
 
 
204 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  35.15 
 
 
197 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.39 
 
 
204 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.39 
 
 
204 aa  101  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 
209 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.24 
 
 
205 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.24 
 
 
205 aa  101  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.24 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.96 
 
 
199 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 
194 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 
213 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.68 
 
 
214 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
196 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
205 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
190 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
205 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.18 
 
 
200 aa  99  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>