More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1268 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1268  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.20539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3204  Holliday junction DNA helicase RuvA  69.15 
 
 
202 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0988  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.49 
 
 
202 aa  255  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.85 
 
 
201 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.83 
 
 
204 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.18 
 
 
199 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3492  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
198 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.36 
 
 
197 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.73 
 
 
202 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  50 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.58 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.41 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
193 aa  118  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.54 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.73 
 
 
198 aa  117  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.55 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.22 
 
 
214 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.6 
 
 
194 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.22 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  42.93 
 
 
202 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37.91 
 
 
205 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.52 
 
 
204 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.35 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.26 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.12 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
202 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.39 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.26 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.73 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  40.8 
 
 
191 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.89 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.25 
 
 
202 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.08 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.14 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.44 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.64 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.15 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.84 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.45 
 
 
205 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3953  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.2 
 
 
191 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0761943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.45 
 
 
205 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.59 
 
 
199 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.68 
 
 
197 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.45 
 
 
205 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.63 
 
 
198 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.43 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.21 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
205 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.59 
 
 
199 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  36.18 
 
 
193 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
196 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
196 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
190 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
196 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
220 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.59 
 
 
195 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.16 
 
 
190 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
201 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.55 
 
 
214 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
201 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.2 
 
 
193 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
202 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.23 
 
 
200 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4094  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.3 
 
 
190 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.12 
 
 
206 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.69 
 
 
193 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.22 
 
 
224 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
197 aa  104  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.22 
 
 
224 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.62 
 
 
202 aa  104  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.19 
 
 
194 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
200 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  38.86 
 
 
199 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
207 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>