More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1993 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
200 aa  370  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  70.39 
 
 
202 aa  234  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.42 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  57.35 
 
 
206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  57.79 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  58.82 
 
 
202 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
202 aa  187  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.46 
 
 
205 aa  184  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.92 
 
 
196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  54.07 
 
 
209 aa  178  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.25 
 
 
200 aa  177  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  51.76 
 
 
199 aa  177  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  51.21 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.82 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.66 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.85 
 
 
206 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.85 
 
 
200 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55.88 
 
 
206 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.17 
 
 
206 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.59 
 
 
247 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.2 
 
 
214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.53 
 
 
196 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
196 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.53 
 
 
196 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.53 
 
 
196 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.24 
 
 
208 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.35 
 
 
200 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.07 
 
 
212 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.25 
 
 
197 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.3 
 
 
207 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.02 
 
 
214 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  55.56 
 
 
239 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.59 
 
 
213 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.67 
 
 
195 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.36 
 
 
195 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.43 
 
 
199 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
199 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.05 
 
 
195 aa  124  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.71 
 
 
204 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
197 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.32 
 
 
203 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.58 
 
 
194 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
207 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.69 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.61 
 
 
209 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.19 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.9 
 
 
201 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  35.96 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.65 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.37 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
200 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  38.8 
 
 
194 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.16 
 
 
194 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
197 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
197 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.57 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.57 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.63 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
187 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.84 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.41 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.91 
 
 
210 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
202 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.78 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1268  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.46 
 
 
204 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.20539  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
213 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.25 
 
 
194 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.5 
 
 
194 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.92 
 
 
202 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
203 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.6 
 
 
193 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.79 
 
 
197 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3204  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.49 
 
 
202 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  38.28 
 
 
203 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  38.28 
 
 
203 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
195 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.17 
 
 
199 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
201 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
202 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
199 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.29 
 
 
209 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.68 
 
 
208 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
201 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.8 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.8 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.56 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  30.93 
 
 
194 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  31.31 
 
 
199 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>