More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5145 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  100 
 
 
239 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  63.1 
 
 
247 aa  248  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.04 
 
 
196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.89 
 
 
202 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.5 
 
 
202 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.77 
 
 
206 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.9 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55 
 
 
206 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.25 
 
 
200 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.08 
 
 
200 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  52.75 
 
 
200 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.57 
 
 
209 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.56 
 
 
207 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.04 
 
 
208 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.8 
 
 
200 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.76 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.71 
 
 
206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.91 
 
 
205 aa  161  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.95 
 
 
212 aa  161  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55.49 
 
 
206 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  47.8 
 
 
199 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
207 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  49.73 
 
 
209 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.33 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.35 
 
 
197 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.56 
 
 
200 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.32 
 
 
196 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.32 
 
 
196 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.32 
 
 
196 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.03 
 
 
196 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.16 
 
 
213 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  45.21 
 
 
205 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  45 
 
 
214 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.55 
 
 
197 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.86 
 
 
199 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.34 
 
 
195 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.25 
 
 
195 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.86 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.46 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.91 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.63 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
203 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
207 aa  111  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.16 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.98 
 
 
207 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  33.33 
 
 
208 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.67 
 
 
206 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.84 
 
 
202 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.56 
 
 
208 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37.04 
 
 
197 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.61 
 
 
202 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  36.72 
 
 
194 aa  105  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.49 
 
 
205 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.39 
 
 
199 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
202 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.44 
 
 
201 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.11 
 
 
208 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.22 
 
 
205 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
202 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.66 
 
 
202 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
199 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  40.22 
 
 
212 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.87 
 
 
209 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.25 
 
 
195 aa  101  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.89 
 
 
201 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  35.71 
 
 
199 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.89 
 
 
201 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.11 
 
 
199 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  33.71 
 
 
194 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  34.81 
 
 
194 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0988  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.61 
 
 
202 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
195 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
205 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.36 
 
 
187 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
206 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  30.85 
 
 
199 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.16 
 
 
199 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.46 
 
 
205 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.12 
 
 
193 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.16 
 
 
199 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.23 
 
 
205 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.46 
 
 
205 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.7 
 
 
197 aa  99.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.15 
 
 
193 aa  99.4  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.67 
 
 
193 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  36.07 
 
 
206 aa  98.6  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.7 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
199 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.42 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.2 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.18 
 
 
201 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>