More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3054 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
209 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  67.49 
 
 
202 aa  230  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  58.62 
 
 
200 aa  207  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  57.84 
 
 
206 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.5 
 
 
200 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.25 
 
 
207 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.88 
 
 
205 aa  188  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.69 
 
 
196 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55.12 
 
 
202 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.16 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.3 
 
 
198 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.24 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.37 
 
 
206 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.62 
 
 
207 aa  171  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.18 
 
 
247 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.5 
 
 
200 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.24 
 
 
196 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55.02 
 
 
206 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.24 
 
 
196 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.24 
 
 
196 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.27 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.08 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.51 
 
 
214 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.64 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.47 
 
 
197 aa  161  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.24 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.74 
 
 
196 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
214 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  52.38 
 
 
209 aa  158  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  48.8 
 
 
205 aa  157  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  58.89 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.55 
 
 
213 aa  151  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.85 
 
 
195 aa  151  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.88 
 
 
195 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.7 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.37 
 
 
199 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.56 
 
 
204 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.83 
 
 
197 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.32 
 
 
203 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.35 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  40.61 
 
 
194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.16 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.85 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.7 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  37.44 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.5 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.1 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
223 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.11 
 
 
209 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
192 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.78 
 
 
198 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.98 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  37.14 
 
 
208 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.8 
 
 
196 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.88 
 
 
197 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
208 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  37.5 
 
 
203 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.76 
 
 
202 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  32.23 
 
 
203 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.91 
 
 
206 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 
205 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.13 
 
 
214 aa  104  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
187 aa  104  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
203 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
203 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
205 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
205 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 
209 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
205 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.65 
 
 
202 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
203 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.06 
 
 
201 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.06 
 
 
201 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.35 
 
 
204 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.02 
 
 
205 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  37.5 
 
 
199 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  32.81 
 
 
199 aa  101  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
194 aa  101  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
200 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.69 
 
 
197 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
200 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.91 
 
 
203 aa  101  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
201 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.54 
 
 
203 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.31 
 
 
207 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.54 
 
 
203 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.32 
 
 
201 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
209 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>