More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  100 
 
 
206 aa  394  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.88 
 
 
202 aa  243  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.77 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.9 
 
 
207 aa  228  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  57 
 
 
202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  54.73 
 
 
200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.08 
 
 
202 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.07 
 
 
209 aa  188  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.5 
 
 
198 aa  186  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.19 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.71 
 
 
200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.22 
 
 
197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.93 
 
 
212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.37 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.69 
 
 
206 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.66 
 
 
196 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.16 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.23 
 
 
196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.88 
 
 
200 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.96 
 
 
196 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.96 
 
 
196 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.96 
 
 
196 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.11 
 
 
206 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.98 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.14 
 
 
208 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  50.48 
 
 
205 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.43 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  51.67 
 
 
209 aa  165  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.5 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
195 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.06 
 
 
214 aa  158  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.27 
 
 
247 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  52 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  54.44 
 
 
239 aa  154  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.02 
 
 
195 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.96 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.59 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  38.24 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.19 
 
 
209 aa  132  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.06 
 
 
197 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
197 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.62 
 
 
204 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.11 
 
 
200 aa  118  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.91 
 
 
203 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.97 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.2 
 
 
199 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.97 
 
 
201 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.61 
 
 
199 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.6 
 
 
207 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  42.37 
 
 
197 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.79 
 
 
197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.18 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  40.23 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
200 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.64 
 
 
194 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.39 
 
 
209 aa  111  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.47 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  37.99 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.43 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.91 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.96 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
205 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.2 
 
 
197 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.43 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  33.66 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.14 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.91 
 
 
187 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
197 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
200 aa  107  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.85 
 
 
195 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
205 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
202 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1701  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.61 
 
 
202 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.5557  normal  0.955622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.83 
 
 
193 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.57 
 
 
210 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
197 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.45 
 
 
202 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.31 
 
 
206 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
202 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.02 
 
 
198 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
199 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.11 
 
 
197 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
198 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.57 
 
 
201 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
190 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.92 
 
 
197 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.55 
 
 
199 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.53 
 
 
196 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.3 
 
 
204 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.98 
 
 
199 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
205 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.29 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
205 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>