More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3827 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.79 
 
 
200 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  59 
 
 
200 aa  193  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55 
 
 
202 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  51.74 
 
 
200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.27 
 
 
202 aa  187  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.81 
 
 
212 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  52.71 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.52 
 
 
202 aa  177  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.43 
 
 
206 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50 
 
 
206 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.5 
 
 
199 aa  174  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.03 
 
 
206 aa  174  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.27 
 
 
247 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  47.69 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.78 
 
 
213 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.14 
 
 
198 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.54 
 
 
208 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.09 
 
 
207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.49 
 
 
197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.55 
 
 
205 aa  162  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.29 
 
 
214 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.45 
 
 
207 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.5 
 
 
196 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.5 
 
 
196 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.5 
 
 
196 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
196 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.71 
 
 
214 aa  154  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.75 
 
 
200 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.53 
 
 
209 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.67 
 
 
209 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  48.95 
 
 
239 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  43.63 
 
 
205 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.38 
 
 
199 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.5 
 
 
195 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.5 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.22 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  39.34 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
200 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38 
 
 
197 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
197 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
198 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.11 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.2 
 
 
200 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
199 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.71 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.64 
 
 
207 aa  111  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.19 
 
 
197 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.33 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.57 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
201 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
201 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
207 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.04 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.86 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.89 
 
 
197 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.89 
 
 
197 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.85 
 
 
199 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.29 
 
 
194 aa  106  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.16 
 
 
209 aa  106  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
210 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.68 
 
 
193 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.68 
 
 
193 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
199 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.62 
 
 
197 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.67 
 
 
207 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
199 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
197 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.84 
 
 
214 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.14 
 
 
202 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  38.98 
 
 
199 aa  104  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.1 
 
 
202 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.41 
 
 
205 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
187 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
193 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.48 
 
 
205 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  29.08 
 
 
194 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.08 
 
 
199 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.44 
 
 
206 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.67 
 
 
203 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.8 
 
 
205 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.48 
 
 
205 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
205 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>