More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4681 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
207 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.25 
 
 
207 aa  250  9.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.4 
 
 
210 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.4 
 
 
210 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.59 
 
 
213 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.62 
 
 
212 aa  220  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.2 
 
 
209 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.74 
 
 
202 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.09 
 
 
233 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.78 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.78 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.68 
 
 
202 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.27 
 
 
205 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.6 
 
 
214 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.58 
 
 
205 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.58 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.47 
 
 
214 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0168  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.61 
 
 
119 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.33 
 
 
202 aa  140  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.55 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.55 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.23 
 
 
206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.13 
 
 
193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.68 
 
 
199 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
193 aa  127  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.6 
 
 
206 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.68 
 
 
200 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.2 
 
 
205 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
194 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.43 
 
 
193 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.43 
 
 
193 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
193 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.02 
 
 
198 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
204 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
207 aa  124  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
204 aa  124  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
204 aa  124  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.31 
 
 
199 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.02 
 
 
198 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.23 
 
 
208 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
193 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.67 
 
 
204 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
193 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.76 
 
 
199 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.19 
 
 
220 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.11 
 
 
205 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  39.34 
 
 
194 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
200 aa  121  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
205 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
205 aa  121  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
205 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
205 aa  121  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0377  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.31 
 
 
193 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0165  DNA recombination protein, RuvA  61.46 
 
 
109 aa  121  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  40 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.27 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.79 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.32 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
205 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0392  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
193 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.63 
 
 
199 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
205 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
205 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
205 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.96 
 
 
204 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.28 
 
 
223 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.8 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.27 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.13 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.78 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.47 
 
 
199 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.47 
 
 
199 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
200 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.92 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.16 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.84 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  37.31 
 
 
191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.19 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.72 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
193 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.55 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.84 
 
 
197 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.21 
 
 
205 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0510  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.66 
 
 
192 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.57 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.59 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.47 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.96 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.21 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.04 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>