More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2298 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
207 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.25 
 
 
207 aa  266  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.67 
 
 
210 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.67 
 
 
210 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.28 
 
 
209 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.79 
 
 
213 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.28 
 
 
212 aa  197  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.38 
 
 
202 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.95 
 
 
202 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.95 
 
 
202 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.67 
 
 
201 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.67 
 
 
201 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
205 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
205 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
205 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.52 
 
 
205 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.78 
 
 
202 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.6 
 
 
214 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.51 
 
 
193 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.96 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  43 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.79 
 
 
194 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  42.79 
 
 
194 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
194 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.32 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.33 
 
 
214 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0168  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.26 
 
 
119 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.38 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  37.91 
 
 
206 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.91 
 
 
205 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.38 
 
 
205 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.95 
 
 
197 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.19 
 
 
233 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.05 
 
 
205 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  36.49 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.81 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
205 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
193 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
193 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
205 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
199 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
199 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.02 
 
 
200 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.02 
 
 
200 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
204 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.51 
 
 
205 aa  131  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.89 
 
 
223 aa  131  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.31 
 
 
192 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.09 
 
 
208 aa  131  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.91 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.35 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.51 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  41.55 
 
 
191 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
200 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.22 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.65 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.75 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.93 
 
 
204 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.74 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.76 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.91 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.76 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.97 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.76 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  39.71 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.49 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.61 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  39.71 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.11 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.54 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
193 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.23 
 
 
200 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.91 
 
 
209 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.16 
 
 
193 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0377  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.58 
 
 
193 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.04 
 
 
210 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
223 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0392  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.58 
 
 
193 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.32 
 
 
203 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>