More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2820 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  88.04 
 
 
212 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.59 
 
 
207 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.95 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.95 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.2 
 
 
209 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.79 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.89 
 
 
205 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.89 
 
 
205 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.54 
 
 
202 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.06 
 
 
205 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0168  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.1 
 
 
119 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.42 
 
 
194 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.06 
 
 
202 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
202 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.89 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.26 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.59 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.63 
 
 
202 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  37.3 
 
 
191 aa  118  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.64 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.58 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.58 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.24 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.17 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.85 
 
 
197 aa  111  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
193 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.92 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.94 
 
 
214 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.65 
 
 
199 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3953  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.59 
 
 
191 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0761943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.54 
 
 
199 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
206 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.1 
 
 
190 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.57 
 
 
199 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
203 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.87 
 
 
200 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.54 
 
 
193 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
193 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.38 
 
 
204 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.38 
 
 
204 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.38 
 
 
204 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.54 
 
 
193 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 
223 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  33.33 
 
 
194 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
193 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.79 
 
 
200 aa  104  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.4 
 
 
200 aa  104  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.46 
 
 
206 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
203 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.45 
 
 
204 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0165  DNA recombination protein, RuvA  56.12 
 
 
109 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.88 
 
 
194 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0857  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  26.48 
 
 
225 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0640033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.86 
 
 
198 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.88 
 
 
209 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
203 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
210 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
203 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  31.58 
 
 
203 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  31.58 
 
 
203 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.74 
 
 
207 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.54 
 
 
203 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
192 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.41 
 
 
211 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.64 
 
 
200 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.26 
 
 
197 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.07 
 
 
200 aa  101  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.78 
 
 
196 aa  101  9e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
206 aa  101  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.97 
 
 
190 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.01 
 
 
197 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
214 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.7 
 
 
192 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.11 
 
 
209 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.6 
 
 
220 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.07 
 
 
194 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  33.16 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
233 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.27 
 
 
208 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.24 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.21 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.56 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.06 
 
 
203 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.06 
 
 
203 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.06 
 
 
203 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.49 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.06 
 
 
203 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.41 
 
 
199 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>