More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0165 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0165  DNA recombination protein, RuvA  100 
 
 
109 aa  221  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.58 
 
 
209 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.46 
 
 
207 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.59 
 
 
210 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.59 
 
 
210 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.16 
 
 
212 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.12 
 
 
213 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.18 
 
 
207 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.11 
 
 
223 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.58 
 
 
233 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.95 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.05 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.84 
 
 
201 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.43 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.67 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.84 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.16 
 
 
201 aa  70.5  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.86 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.74 
 
 
200 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.82 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.36 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.16 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.82 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.59 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0268  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.11 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.426034  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.82 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.17 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09371  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.11 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0618985  normal  0.218033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.16 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0392  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.59 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.82 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0377  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.59 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.78 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.71 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.37 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
202 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.78 
 
 
202 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.8 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.06 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.33 
 
 
193 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.33 
 
 
193 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
207 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.31 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.16 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.18 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.9 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.68 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.3 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.18 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.95 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.78 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.95 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.95 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  39.39 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.39 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.39 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.16 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  43.24 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  43.59 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.47 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.78 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1758  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
200 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000583338  normal  0.326714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.16 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0510  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
192 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.37 
 
 
199 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.03 
 
 
193 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.54 
 
 
207 aa  63.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4094  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.29 
 
 
190 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.42 
 
 
205 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.74 
 
 
190 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.38 
 
 
193 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.74 
 
 
201 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.38 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.21 
 
 
205 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.03 
 
 
203 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.76 
 
 
206 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.17 
 
 
202 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.37 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.55 
 
 
209 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.03 
 
 
203 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.03 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1819  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.76 
 
 
205 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.41 
 
 
206 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.04 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3674  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.47 
 
 
205 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000325951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.04 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.04 
 
 
196 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.04 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
193 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.03 
 
 
203 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0739  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.03 
 
 
190 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0805847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
200 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.39 
 
 
199 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.73 
 
 
195 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>