More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0268 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0268  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.426034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09371  Holliday junction DNA helicase RuvA  98.21 
 
 
224 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0618985  normal  0.218033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.44 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.35 
 
 
223 aa  161  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.17 
 
 
214 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.16 
 
 
214 aa  141  8e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0857  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.6 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0640033  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09181  putative holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0728559  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10251  putative holliday junction DNA helicase RuvA  34.82 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.177357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
207 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09161  putative holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
225 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.745862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.97 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.13 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.91 
 
 
202 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.02 
 
 
206 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.82 
 
 
202 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.26 
 
 
207 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.17 
 
 
202 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.82 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.64 
 
 
199 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.64 
 
 
199 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.22 
 
 
207 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
207 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.95 
 
 
207 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.88 
 
 
194 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
204 aa  101  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
205 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
201 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.17 
 
 
204 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
204 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
201 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
212 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
210 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
196 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
210 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
196 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
196 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.94 
 
 
200 aa  99  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.93 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.8 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  32.8 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  37.9 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.26 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  37.82 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.87 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.26 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.17 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.9 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.02 
 
 
205 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.51 
 
 
189 aa  95.9  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.41 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
203 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.74 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.34 
 
 
200 aa  95.1  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.53 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.34 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.79 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.9 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.58 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.16 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.09 
 
 
205 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.98 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.41 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.3 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.89 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.02 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.02 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.02 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  30.22 
 
 
199 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 
194 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.3 
 
 
209 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.41 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.19 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.48 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.77 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
190 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.64 
 
 
197 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.95 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.48 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>