More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10251 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_10251  putative holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
228 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.177357  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09161  putative holliday junction DNA helicase RuvA  56.77 
 
 
225 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.745862  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09181  putative holliday junction DNA helicase RuvA  56.44 
 
 
225 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0728559  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0857  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  54.63 
 
 
225 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0640033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  28 
 
 
214 aa  128  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.34 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0268  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.82 
 
 
224 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.426034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09371  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.65 
 
 
224 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0618985  normal  0.218033 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.19 
 
 
223 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.83 
 
 
195 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.55 
 
 
214 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
209 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.28 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.28 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.32 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.24 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.37 
 
 
193 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.65 
 
 
193 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
193 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.5 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  92  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.86 
 
 
193 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.46 
 
 
193 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.2 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.28 
 
 
193 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  27.32 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.11 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.37 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.34 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.37 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.34 
 
 
190 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.32 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.78 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0392  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0377  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.47 
 
 
205 aa  85.9  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.9 
 
 
197 aa  85.9  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.65 
 
 
200 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.65 
 
 
197 aa  85.5  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  33.81 
 
 
194 aa  85.5  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  27.12 
 
 
197 aa  85.5  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_002620  TC0788  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.5 
 
 
200 aa  85.1  8e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.128261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  27.38 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.28 
 
 
189 aa  85.1  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.95 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.32 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.43 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
194 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.37 
 
 
202 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.28 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.69 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.95 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.71 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.76 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.83 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  35.25 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.03 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.41 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.32 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  24.11 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.84 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.73 
 
 
541 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.32 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.92 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.73 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.73 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.73 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.73 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  23.88 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.73 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.73 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  28.57 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 
201 aa  82  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  23.08 
 
 
200 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.37 
 
 
205 aa  82  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.32 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  22.97 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.89 
 
 
223 aa  82  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.18 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.42 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.7 
 
 
205 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>