More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07021 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
233 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.21 
 
 
214 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09371  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.35 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0618985  normal  0.218033 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0268  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.35 
 
 
224 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.426034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.28 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 
207 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.7 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.7 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.13 
 
 
207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.48 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.48 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.05 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.83 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
210 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.87 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.13 
 
 
211 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10251  putative holliday junction DNA helicase RuvA  28.19 
 
 
228 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.177357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.19 
 
 
205 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.11 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
202 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
202 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09181  putative holliday junction DNA helicase RuvA  27.03 
 
 
225 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0728559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.85 
 
 
201 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
205 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.25 
 
 
206 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.52 
 
 
209 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
205 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.24 
 
 
207 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
205 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.02 
 
 
198 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 
205 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
202 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 
205 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 
205 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  31.1 
 
 
203 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
205 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
201 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1819  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.36 
 
 
205 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
201 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.09 
 
 
205 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  34.9 
 
 
206 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.37 
 
 
204 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.48 
 
 
194 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.27 
 
 
205 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.27 
 
 
205 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.27 
 
 
205 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.27 
 
 
205 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.89 
 
 
196 aa  102  4e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.58 
 
 
205 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.42 
 
 
190 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.52 
 
 
197 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.45 
 
 
193 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2103  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.74 
 
 
205 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.01 
 
 
203 aa  101  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.77 
 
 
209 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.29 
 
 
200 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.55 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.71 
 
 
199 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.77 
 
 
223 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
212 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.86 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.36 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.98 
 
 
204 aa  99  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.32 
 
 
189 aa  99  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.69 
 
 
194 aa  99  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.29 
 
 
193 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09161  putative holliday junction DNA helicase RuvA  27.56 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.745862  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0857  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.9 
 
 
225 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0640033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 
199 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.45 
 
 
200 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.31 
 
 
205 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.74 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.45 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.93 
 
 
199 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.51 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2146  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.9 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
194 aa  95.9  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.62 
 
 
192 aa  95.1  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>