More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09181 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_09181  putative holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0728559  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09161  putative holliday junction DNA helicase RuvA  93.33 
 
 
225 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.745862  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0857  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  78.83 
 
 
225 aa  344  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0640033  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10251  putative holliday junction DNA helicase RuvA  56.44 
 
 
228 aa  245  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.177357  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.96 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.09 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0268  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 
224 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.426034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 
193 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09371  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0618985  normal  0.218033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.05 
 
 
214 aa  108  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07021  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.03 
 
 
223 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0478763  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.04 
 
 
202 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.57 
 
 
193 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.87 
 
 
193 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.07 
 
 
193 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.97 
 
 
194 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.06 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.12 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.15 
 
 
197 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.94 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  29.38 
 
 
206 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.67 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.69 
 
 
202 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.67 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.39 
 
 
190 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.66 
 
 
201 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.66 
 
 
201 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.3 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.69 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.85 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.51 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.8 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.37 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.41 
 
 
209 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.8 
 
 
205 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.37 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.21 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.8 
 
 
205 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.66 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.63 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.37 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.8 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0424  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
193 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702078  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3674  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000325951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  24.54 
 
 
206 aa  92.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.95 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.16 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.37 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.66 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.31 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  26.88 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.27 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  30.5 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  30.5 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.49 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.8 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.49 
 
 
200 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.49 
 
 
200 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3138  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.22 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.08 
 
 
193 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  25.82 
 
 
198 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
203 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
203 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
203 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
203 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.22 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.22 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.22 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.22 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.22 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.4 
 
 
541 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.22 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0788  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.79 
 
 
200 aa  88.6  8e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.128261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.57 
 
 
190 aa  88.6  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.31 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>