More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0811 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
202 aa  401  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  43.07 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
193 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.89 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.79 
 
 
198 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  38.61 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.07 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  40.59 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
200 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.54 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.44 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4464  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.07 
 
 
199 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.07 
 
 
199 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.92 
 
 
197 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.41 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.12 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.41 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.86 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.82 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.89 
 
 
197 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.7 
 
 
193 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.94 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.41 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  35.41 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0926  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
193 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
202 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
205 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
202 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
196 aa  111  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
200 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.96 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
203 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
205 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000711774  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 
200 aa  109  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  34.63 
 
 
204 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.12 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.17 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.27 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.98 
 
 
201 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.98 
 
 
201 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0457  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
204 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
199 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.8 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
204 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 
200 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
206 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.13 
 
 
203 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
201 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
204 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0788  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
200 aa  105  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.128261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4316  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4154  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000374115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4165  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
205 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.44 
 
 
205 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
204 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
193 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.12 
 
 
199 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
188 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
541 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.43 
 
 
206 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
190 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1758  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
200 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000583338  normal  0.326714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.09 
 
 
193 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
199 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.12 
 
 
204 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.44 
 
 
205 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
206 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>