More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1209 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
188 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.27 
 
 
186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0807  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 
184 aa  157  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.99 
 
 
184 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.2 
 
 
184 aa  156  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0113  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.06 
 
 
184 aa  150  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0890  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 
183 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1211  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.15 
 
 
183 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0820  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 
183 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  38.5 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  38.5 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0633  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.84 
 
 
183 aa  129  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.6 
 
 
205 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  38.92 
 
 
206 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
205 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
205 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
205 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
205 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
205 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
205 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
205 aa  124  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  124  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
204 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
204 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
204 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  40.4 
 
 
206 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
207 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
205 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.2 
 
 
202 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
203 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
203 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
203 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
203 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
203 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
194 aa  121  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
205 aa  121  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
202 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.44 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.82 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.46 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
201 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.18 
 
 
202 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
201 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.06 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.27 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.14 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.74 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2146  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
204 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.07 
 
 
203 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.71 
 
 
201 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.5 
 
 
206 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.94 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
196 aa  111  6e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  38.25 
 
 
208 aa  111  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.6 
 
 
197 aa  111  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.14 
 
 
204 aa  110  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.3 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1819  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2103  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.97 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  35.35 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.95 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0973  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.78 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
209 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
199 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
199 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.38 
 
 
193 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
197 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.85 
 
 
190 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
202 aa  105  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.51 
 
 
194 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
207 aa  104  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>