More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0890 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0890  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0820  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1211  Holliday junction DNA helicase RuvA  98.9 
 
 		 183 aa  360  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0633  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.03 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141777  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.87 
 
 		 184 aa  224  6e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0113  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.41 
 
 		 184 aa  224  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.52 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0807  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.43 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.76 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.89 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.89 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.52 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.46 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  29 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.94 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  29.7 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  29.7 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 		 200 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.86 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.86 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  34.85 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.96 
 
 		 211 aa  98.6  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.98 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 		 193 aa  98.2  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.21 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 		 202 aa  97.8  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.96 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.98 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 		 200 aa  97.4  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.06 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.43 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.06 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.94 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.06 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0377  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.68 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0392  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 193 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.29 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.41 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.41 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.9 
 
 		 209 aa  94.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.36 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.67 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.3 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0493  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.75 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0568272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  28 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.28 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.99 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.28 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.36 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  29.9 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.37 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4240  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215143 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.95 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 		 199 aa  91.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.8 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.72 
 
 		 207 aa  90.9  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.89 
 
 		 193 aa  90.9  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3700  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.75 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.47 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.02 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  28.36 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>