More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0633 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0633  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0890  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.03 
 
 		 183 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0820  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.03 
 
 		 183 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1211  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.84 
 
 		 183 aa  254  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0113  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.59 
 
 		 184 aa  239  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.59 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.7 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0807  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.07 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.76 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.46 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  36.87 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.83 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.99 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.59 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.59 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.59 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.59 
 
 		 205 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.44 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.15 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 		 202 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.93 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.28 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.08 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.65 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.85 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.85 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 		 204 aa  91.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.47 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.79 
 
 		 201 aa  90.9  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.47 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.47 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  29.85 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  29.85 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.95 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.35 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.3 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  34 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.21 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.8 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.38 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.71 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.93 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.63 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.36 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.98 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.69 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.72 
 
 		 214 aa  88.2  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0726  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 		 198 aa  88.2  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.12 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.37 
 
 		 194 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 		 197 aa  87.8  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.29 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.29 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.65 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.81 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.64 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.06 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.81 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.81 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.06 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.05 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.81 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.06 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.5 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>