More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0807 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0807  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.85 
 
 		 184 aa  248  3e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0113  Holliday junction DNA helicase RuvA  66.67 
 
 		 184 aa  248  5e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.67 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0890  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.43 
 
 		 183 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0820  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.43 
 
 		 183 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0633  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.52 
 
 		 183 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141777  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1211  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.19 
 
 		 183 aa  200  9e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.54 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.45 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 		 194 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  38.14 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.63 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.12 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 		 202 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 		 194 aa  104  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.44 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.78 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.31 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  34.47 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.42 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.72 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 		 205 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  36.32 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.27 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.02 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.69 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 		 200 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2556  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.42 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.209185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.08 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.08 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.08 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.08 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.08 
 
 		 193 aa  98.6  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.53 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 		 207 aa  97.4  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  36.41 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  35.35 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.25 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0267  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2354  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2533  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3406  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3365  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3400  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.83 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1129  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.31 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.67 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.54 
 
 		 210 aa  95.5  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  32.67 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.07 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0501  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.38 
 
 		 193 aa  95.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.25 
 
 		 209 aa  94.4  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.34 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>