More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1051 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0113  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.3 
 
 
184 aa  202  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.15 
 
 
184 aa  200  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0807  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.54 
 
 
184 aa  192  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0890  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.76 
 
 
183 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0820  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.76 
 
 
183 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.61 
 
 
184 aa  189  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1211  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.51 
 
 
183 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0633  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.76 
 
 
183 aa  184  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141777  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.27 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
202 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
200 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
202 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
202 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  35.86 
 
 
199 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  31.68 
 
 
203 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  31.68 
 
 
203 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
203 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.75 
 
 
211 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
203 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 
203 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
204 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
204 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
204 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  104  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  104  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  104  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
205 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  104  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
193 aa  104  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.54 
 
 
193 aa  104  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
205 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
205 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 
205 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
210 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
205 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.24 
 
 
207 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 
198 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.98 
 
 
196 aa  101  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.92 
 
 
207 aa  101  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  101  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
194 aa  101  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 
194 aa  101  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
204 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.37 
 
 
206 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.46 
 
 
194 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.24 
 
 
207 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.47 
 
 
196 aa  100  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.88 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.35 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
197 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.71 
 
 
199 aa  98.2  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.85 
 
 
206 aa  97.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.42 
 
 
200 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.42 
 
 
200 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.43 
 
 
201 aa  97.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.24 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.22 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.8 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.8 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  29.9 
 
 
206 aa  95.9  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.92 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.47 
 
 
209 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.05 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
205 aa  94.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.58 
 
 
189 aa  94.4  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.91 
 
 
205 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.03 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0639  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.98 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.84 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.96 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>