More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0573 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
184 aa  365  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0113  Holliday junction DNA helicase RuvA  69.4 
 
 
184 aa  250  8.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  68.48 
 
 
184 aa  247  8e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0807  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.67 
 
 
184 aa  238  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0633  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.7 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0890  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.52 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0820  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.52 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1211  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.28 
 
 
183 aa  209  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.61 
 
 
186 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.99 
 
 
188 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
194 aa  118  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
199 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
199 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.42 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.42 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.84 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
205 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  37.11 
 
 
193 aa  111  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
202 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
200 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.82 
 
 
203 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  36.36 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
199 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
201 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
201 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
195 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
201 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 
194 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
203 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
196 aa  104  8e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.33 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.9 
 
 
207 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.54 
 
 
193 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.51 
 
 
194 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
206 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
204 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.33 
 
 
206 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
200 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  33.33 
 
 
206 aa  101  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 
198 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
200 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.72 
 
 
194 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 
194 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.17 
 
 
207 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.38 
 
 
207 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.02 
 
 
194 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.92 
 
 
209 aa  99  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
197 aa  98.2  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  34.48 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
203 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2777  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.88 
 
 
203 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115521  normal  0.0296247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3775  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  30.05 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0582  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.55 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0608  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.55 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0656  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.55 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2695  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.55 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325714  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0206  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.55 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0689  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.55 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1432  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  32.98 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000016322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.85 
 
 
204 aa  95.5  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.88 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2146  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
204 aa  94.4  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.6 
 
 
192 aa  94.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.56 
 
 
223 aa  94.4  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.19 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.53 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.18 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.18 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.29 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>