More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0639 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0639  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 		 200 aa  385  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3674  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.75 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000325951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.02 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.67 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  32.18 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.15 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.53 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.52 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.32 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.2 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  33.14 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.95 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.95 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0788  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.27 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.128261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.5 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.31 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.05 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.47 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.47 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.46 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  31.5 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.94 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.7 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.3 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.56 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.11 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  27.64 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.75 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.61 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.39 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1061  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.21 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.57 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.64 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.85 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.35 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.33 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0942  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.74 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.3 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  33.33 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.06 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.07 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.98 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.15 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.4 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.3 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.17 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.22 
 
 		 206 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.49 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.53 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.8 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2146  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.56 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  31.84 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  34 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.85 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>