More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0442 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  97.94 
 
 
194 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  87.11 
 
 
194 aa  337  7e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.56 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.85 
 
 
197 aa  157  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.13 
 
 
197 aa  144  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.74 
 
 
187 aa  143  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.5 
 
 
202 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.81 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
200 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
205 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
205 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.81 
 
 
205 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.13 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.49 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.34 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.41 
 
 
205 aa  131  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.79 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.1 
 
 
197 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  43.6 
 
 
194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  44.51 
 
 
197 aa  128  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.12 
 
 
206 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  36.27 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.17 
 
 
202 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
199 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
200 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
200 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.29 
 
 
193 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.29 
 
 
193 aa  124  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.46 
 
 
199 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
200 aa  124  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.74 
 
 
190 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
211 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.73 
 
 
205 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.53 
 
 
193 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
214 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.31 
 
 
203 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.32 
 
 
206 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
204 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.95 
 
 
198 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.7 
 
 
200 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.1 
 
 
202 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
200 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
193 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
205 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
205 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
205 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
197 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.93 
 
 
205 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.53 
 
 
201 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
199 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
202 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.56 
 
 
205 aa  121  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.98 
 
 
200 aa  121  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
205 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.46 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.6 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.57 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.55 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
193 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.5 
 
 
202 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.64 
 
 
204 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.58 
 
 
194 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
203 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0457  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.75 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.12 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.8 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 
201 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.87 
 
 
202 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
223 aa  117  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.34 
 
 
201 aa  117  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.32 
 
 
199 aa  117  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.68 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  35.68 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.5 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>